Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcd2Q61285 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms