Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf3Q60980 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms