Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms