Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp18Q5SSI6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp18Q5SSI6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms