Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms