Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms