Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp19Q3UJD6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp19Q3UJD6 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms