Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx27Q3UHD6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx27Q3UHD6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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