Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn2bQ0KL01 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms