Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sh3bp2Q06649 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp2Q06649 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms