Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb2Q00977 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb2Q00977 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms