Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms