Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax8Q00288 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms