Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp9bP98195 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp9bP98195 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp9bP98195 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms