Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gfra1P97785 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms