Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NficP70255 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NficP70255 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NficP70255 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NficP70255 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms