Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tuba4aP68368 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms