Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl18aP62717 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl18aP62717 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl18aP62717 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl18aP62717 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl18aP62717 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl18aP62717 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl18aP62717 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl18aP62717 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl18aP62717 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl18aP62717 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl18aP62717 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rpl18aP62717 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms