Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Snrpd1P62315 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snrpd1P62315 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Snrpd1P62315 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Snrpd1P62315 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Snrpd1P62315 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Snrpd1P62315 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Snrpd1P62315 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Snrpd1P62315 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Snrpd1P62315 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Snrpd1P62315 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Snrpd1P62315 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Snrpd1P62315 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Snrpd1P62315 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrpd1P62315 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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