Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps13P62301 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms