Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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NcstnP57716 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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NcstnP57716 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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NcstnP57716 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NcstnP57716 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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NcstnP57716 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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NcstnP57716 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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NcstnP57716 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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NcstnP57716 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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NcstnP57716 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms