Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Faf1P54731 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Faf1P54731 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Faf1P54731 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Faf1P54731 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Faf1P54731 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Faf1P54731 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Faf1P54731 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Faf1P54731 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Faf1P54731 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms