Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa6P50704 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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