Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pax9P47242 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms