Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Syt1P46096 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Syt1P46096 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syt1P46096 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms