Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LtbP41155 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LtbP41155 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LtbP41155 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LtbP41155 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LtbP41155 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LtbP41155 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LtbP41155 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LtbP41155 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LtbP41155 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LtbP41155 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LtbP41155 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LtbP41155 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LtbP41155 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LtbP41155 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LtbP41155 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LtbP41155 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LtbP41155 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LtbP41155 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LtbP41155 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LtbP41155 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms