Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms