Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp3P28862 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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