Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxrgP28705 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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