Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RxrbP28704 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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