Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dusp1P28563 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms