Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa2P28309 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms