Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ggta1P23336 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ggta1P23336 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ggta1P23336 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ggta1P23336 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ggta1P23336 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ggta1P23336 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ggta1P23336 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ggta1P23336 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ggta1P23336 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ggta1P23336 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ggta1P23336 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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