Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P18532 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18532 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18532 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18532 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18532 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18532 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18532 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18532 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18532 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18532 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18532 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18532 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P18532 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18532 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P18532 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms