Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P18530 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P18530 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18530 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18530 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18530 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18530 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18530 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18530 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18530 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18530 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18530 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P18530 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
P18530 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P18530 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms