Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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