Protein–RNA interactions for Protein: P11672

Lcn2, Neutrophil gelatinase-associated lipocalin, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn2P11672 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lcn2P11672 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms