Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp4O70480 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms