Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ube3aO08759 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ube3aO08759 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ube3aO08759 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ube3aO08759 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ube3aO08759 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ube3aO08759 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ube3aO08759 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ube3aO08759 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ube3aO08759 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube3aO08759 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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