Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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