Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Farp1F8VPU2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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