Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fndc1E9Q043 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms