Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brd1E9PZ26 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms