Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Gcn1E9PVA8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gcn1E9PVA8 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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