Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms