Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms