Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Calcoco2A2A6M5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms