Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Speer3W4VSP1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Speer3W4VSP1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms