Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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