Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms